A nivel de club, destaca el triunfo conseguido en la Copa del Rey de 1986 frente al FC Barcelona, con una victoria por 1-0 en la final disputada en el estadio Vicente Calderón, tras haber eliminado previamente al Real Madrid en semifinales. El Real Zaragoza finalizó la temporada 85/86 en cuarto lugar, y Juan Señor fue el tercer máximo goleador con 15 goles y máximo goleador español, sólo superado por Hugo Sánchez (22 goles) y por su ex compañero Jorge Valdano (16 goles), delanteros del R. Madrid.
Participó en dos ocasiones en competiciones europeas: Recopa 86/87 (eliminado en semifinales por el Ajax de Johan Cruyff, en el que militaban jugadores como Fran Rijkaard, Dennis Bergkamp y Marco Van Basten) y Copa de la UEFA 89/90 (cayendo en dieciseisavos ante el Hamburgo).
Del mundo del fútbol también contamos con grandes figuras mundiales como Alfredo Di Stéfano, Leo Beenhacker, Jorge Valdano y también, con una gran representación del fútbol aragonés como Manolo Villanova y en activo como Arbeloa, Zapater, Lafita, Soriano, Longas, Chus Herrero y Moises entre otros.
Compartió camiseta con jugadores como Jorge Valdano, Raúl Amarilla, Juan Barbas, Rubén Sosa, Pichi Alonso o Frank Rijkaard. Recibió el Premio Don Balón al mejor futbolista español de la Liga (temporada 82-83), a la vez que su compañero Juan Barbas recibía el premio al mejor futbolista extranjero.
EN LA SELECCIÓN ESPAÑOLA
Su gran rendimiento como centrocampista en el Real Zaragoza le convirtió en el jugador zaragocista que más veces ha defendido la camiseta de la selección española, llevándole a jugar 41 partidos con la selección absoluta, 2 partidos en la fase de clasificación con la selección olímpica y 1 partido con la selección A-BIS (24 victorias, 13 empates y 7 derrotas), marcando 6 goles, entre los que destacan el definitivo 12-1 contra Malta en la fase de clasificación para la Eurocopa de Francia 84, o el 1-1 frente a Bélgica en los cuartos de final del Mundial de México 86, con el que España consiguió forzar la prórroga.
Debutó con la selección absoluta el 27/10/82 en el estadio de La Rosaleda (Málaga) frente a Islandia, con victoria española por 1-0 en el primer partido de clasificación para la Eurocopa de Francia. Juan Señor alcanzó el subcampeonato en la Eurocopa 84, jugando como titular en la final ante Francia, en la que España fue derrotada 2-0.